Ajans Beşiktaş - 1 Şubat 2016 tarihinde Hannover 96'dan kiralanan Marcelo Guedes, 2015-2016 sezonunun ikinci yarısında Rhodolfo'nun sakatlanması sonrası ligde ve kupada toplam 16 maçta forma giydi ve 2 gol kaydetti. O sezon 2 sarı kart gören Brezilyalı, 1413 dakika sahada kaldı. Başarılı oyuncu ayrıca Türkiye Kupası'ndaki Konyaspor maçında 1 kırmızı kart gördü.
Şampiyonluğun kazanılmasında büyük pay sahibi olan 30 yaşındaki stoper, 1 Temmuz 2016 tarihinde 2 milyon Euro bonservis bedeliyle takıma katıldı. Tecrübeli oyuncu geçtiğimiz sezon savunmanın değişmeyen ismi oldu. 2016-2017 sezonunda 45 maça çıkan Marcelo, 4043 dakikada sahada kalırken, 3 gol attı. Brezilyalı oyuncu, sezonu 9 sarı kartla tamamladı.