1996-1997 sezonunda Beşiktaş, Rasim Kara teknik direktörlüğünde ligi 74 puanla 2. bitirdi. UEFA'da 3.tura kadar yükselen Kara Kartal, Valencia'ya 2-2 ve 3-1'lik skorlarla elendi.
29 Ocak 2005 tarihinde Vicente Del Bosque'nin kovulmasından sonra takımın başına geçen Rıza Çalımbay, sezonu Beşiktaş'ta tamamladı. Ertesi sezon ligdeki 9 maçta; 3 mağlubiyet, 3 beraberlik alınca 16 Ekim 2005 tarihinde takımdan kovuldu.
6 Temmuz 2007 tarihinde göreve getirilen Ertuğrul Sağlam, Beşiktaş'ı o sezon ligde 3. yaptı. Takım onun döneminde Avrupa'da pek iyi performans gösteremedi. 14 Ekim 2008 tarihinde yollar ayrıldı.
Ertuğrul Sağlam'ın kovulmasından sonra takımın başına Mustafa Denizli getirildi. Tecrübeli teknik direktör, 2002-2003 sezonundan sonra şampiyon olamayan Beşiktaş'ı şampiyon yaptı. Şampiyonlar Ligi'nde grubu 1 galibiyetle sonuncu, Ligi de 64 puanla 4. tamamladı. Beşiktaş'ın başında 82 maça çıkan Denizli, 1. 85 puan ortalamasına sahip...
Bernd Schuster ile yolların ayrılmasından sonra takımın başına 17 Mar 2011 tarihinde Tayfur Havutçu geldi. Yardımcı antrenörlük tecrübesi bulunan Tayfur, 12 maç sonra takımdan gönderildi. Yerine Carlos Carvalhal getirildi.
FEDA sezonunda ateşten gömleği giydi ve Beşiktaş'ın başına geçti. Hasan Türk, Emre Özkan, Erkan Kaş, Mehmet Akyüz ve Sinan Kurumuş gibi genç ve tecrübesiz isimlerin olduğu takımı 58 puanla 3. yaptı. Takımın başında 38 maça çıktı. 1.76 puan ortalaması yakaladı.
Şenol Güneş, Slaven Bilic ile yolların ayrılmasından sonra 11 Haziran 2015 tarihinde Beşiktaş'ın başına geçti. Geldiği sezon siyah-beyazlı takımı şampiyon yaptı. 2016-2017 sezonunda takımın yarısından fazlası değişmesine rağmen şampiyonluğu kimseye kaptırmadı ve Gordon Milne döneminden sonra takım ilk kez üst üste 2 kez şampiyon oldu. Beşiktaş'ı üst üste 2 kez şampiyon yapan ilk yerli teknik direktör olarak tarihe geçti. 65 yaşındaki teknik adam Beşiktaş'ın başında 102 maça çıktı ve 2.06 puan ortalaması yakaladı.