Ajans Beşiktaş - 22 Ocak 1992 yılında Kamerun'un Garoua şehrinde dünyaya gelen Aboubakar, forvet bölgesinde oynamaktadır. 1.84 cm boyunda olan Kamerunlu yıldız, kariyerine Coton Sport'ta başladı. Aboubakar, 2010 yılında Coton Sport'tan Fransız ekibi Valenciennes'e transfer oldu.
Burada çıktığı 81 resmi maçta 4.587 dakika forma giyen Aboubakar, 15 gol 9 asist yaparak, bir diğer Fransız ekibi Lorient'in dikkatini çekti.
Aboubakar, 2013 yılında bedelsiz bir şekilde Lorient'e transfer oldu. Kamerunlu golcü, burada çıktığı 38 resmi maçta, 17 gol, 8 asist kaydederek Portekiz devi Porto'nun radarına girdi. Yıldız oyuncu 2014 yılında, 12.3 milyon Euro bedelle Porto'ya transfer oldu.
Aboubakar, Porto ile çıktığı 125 resmi maçta, 7.852 dakika forma giydi. Kamerunlu yıldız bu maçlarda 58 gol, 16 asist yaptı. Aboubakar, Porto formasını 2014-15, 15-16, 17-18, 18-19 ve 19-20 sezonlarında giydi.
2016-17 sezonunda Beşiktaş'a kiralık olarak transfer olan Aboubakar, siyah beyazlı ekipte çıktığı 38 resmi maçta, 2.423 dakika forma giydi. Bu maçlarda 19 gol, 4 asist yapan Aboubakar, Beşiktaş ile bir Süper Lig şampiyonluğu yaşadı.
Yıldız oyuncu, 2017-18 sezonunda geri döndüğü Porto'da kötü sakatlıklar geçirerek perofmans olarak düşüş yaşadı. İstediği kadar süre alamayan Aboubakar, 2020-21 sezonu başında bonservisiyle beraber Beşiktaş'a transfer oldu.
Kamerunlu golcünün, Transfermakt'ta yer alan güncel piyasa değeri ise 5 milyon Euro.